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作科所开发的小麦SNP芯片入选 国家“十三五”重大科技成就

  10月21日,由中国农业科学院作物科学研究所小麦基因资源发掘与利用创新团队自主开发的660K高密度和55K中密度SNP芯片在国家“十三五”科技创新成就展上亮相。

  据介绍,该团队利用自主测序的小麦D基因组祖先种粗山羊草和普通小麦矮抗58以及400份小麦材料重测序获得的基因组变异信息,独立开发了有完全知识产权的660K高密度与55K中密度SNP芯片。与国外的同类芯片相比,上述两款芯片具有通量高、检测效率高、性价比高的优点,是当前小麦分子标记的首选SNP芯片。高通量660K单张芯片可检测66万个位点,这是该团队在多倍体作物SNP芯片研制上的首创,此前国外开发的多倍体作物单张芯片检测位点最多只有40多万;中通量55K芯片效率是目前世界上同类产品中检测效率最高的芯片,有效标记数在90%以上,一个双亲作图群体可定位到遗传图谱上的SNP标记高达35000个。多家国内小麦科研与育种单位已利用这两款芯片,检测到与小麦抗病、抗逆、株型、品质和产量等重要农艺性状基因/QTL 1000余个,发表相关文章100余篇。

  随着研究的进一步深入,这两款小麦芯片将在我国小麦基础与应用研究领域发挥更大的作用。



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